O Conselho Fiscal fiscaliza as atividades financeiras e patrimoniais da FBDS.
A atuação inclui o exame de livros e documentos de escrituração, emissão de parecer sobre a prestação anual de contas da instituição e acompanhamento do processo anual de prestação de contas perante o Ministério Público.
O atual Conselho Fiscal é composto pelos membros Sergio Brilhante de Albuquerque, Vanderléa Regina Paiva e José Carlos Vasconcelos Andrade.