O projeto tem como objetivo a proposição de um modelo de organização com competência para gerir e viabilizar as ações relacionadas à recuperação ambiental e ao desenvolvimento sustentável da Baía de Guanabara.
O trabalho deverá detalhar os processos organizacionais e níveis decisórios do modelo a ser proposto, levando em consideração as diversas instituições existentes, suas competências e atribuições legais, explicitando o papel e as responsabilidades de cada representante, dentre as quais, a Câmara Metropolitana de Integração Governamental (CIG) e o Comitê da Bacia Hidrográfica da Baia de Guanabara.
Nesse sentido, para que a estrutura de governança tenha representatividade, legitimidade, produtividade e que se posicione de forma adequada no complexo contexto político-institucional em que irá atuar, a FBDS deverá indicar os meios para garantir que o processo de desenvolvimento da estrutura de governança obtenha o envolvimento e engajamento de representantes dos organismos governamentais e dos setores da sociedade civil interessados.