O plano de governança fez a proposição de um modelo de organização com competência para gerir e viabilizar as ações relacionadas à recuperação ambiental e ao desenvolvimento sustentável da Baía de Guanabara.
O trabalho detalhou os processos organizacionais e níveis decisórios do modelo proposto, levando em consideração as diversas instituições existentes, suas competências e atribuições legais, identificando o papel e as responsabilidades de cada representante, entre eles a Câmara Metropolitana de Integração Governamental (CIG) e o Comitê da Bacia Hidrográfica da Baia de Guanabara.